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被AI催火的计算生物学赛道

发布时间:2022-08-21 19:03:03 所属栏目:经营推广 来源:科技日报
导读:  近日,AI预测蛋白质结构又取得新突破。“深层思维”公司宣布,该公司开发的人工智能程序“阿尔法折叠”(AlphaFold)已预测出约100万个物种的超过2亿种蛋白质的结构,涵盖科学界已编录的几乎每一种蛋白质。  据

  近日,AI预测蛋白质结构又取得新突破。“深层思维”公司宣布,该公司开发的人工智能程序“阿尔法折叠”(AlphaFold)已预测出约100万个物种的超过2亿种蛋白质的结构,涵盖科学界已编录的几乎每一种蛋白质。

  据介绍,这些信息将上传至可公开访问的“阿尔法折叠蛋白质结构数据库”。该数据库由“深层思维”公司和欧洲生物信息学研究所合作开发,去年7月上线时已包含98.5%的人类蛋白质结构。

  近几年,AI预测蛋白质结构成绩亮眼,各大国内外企业也纷纷入局。在AI激活、数据驱动下,AI预测蛋白质结构正从幕后走向台前,其产业化发展也正进入一个新的阶段。

  AI预测蛋白质结构背后的计算生物学

  蛋白质的三维结构决定了它在细胞中的功能。明确蛋白质的结构信息,在药物研发等领域十分重要。传统上,研究人员使用X射线晶体学等手段测定蛋白质结构,耗时费力且花销不菲,却常无法获得所需结果。“阿尔法折叠”通过学习实验测定出的蛋白质结构信息,来预测其他蛋白质的三维结构,其预测准确度相当高。欧洲生物信息学研究所的数据显示,阿尔法折叠有35%的预测是高度准确的,可媲美实验测定结果;另有45%的预测足以在很多场景使用。

  人工智能极大提升了蛋白质结构预测的效率,这也是AI预测蛋白质结构近几年被人熟知的原因,但其背后的计算生物学却已经历多年发展。计算生物学是根据不同类型的生物数据构建算法和模型,从而理解生物系统本身,并推进相关研究及应用的学科。

  随着人工智能的发展,计算生物学正在被激活。浦发硅谷银行《医疗健康行业投资与退出趋势》报告显示,2021年美国市场投向计算生物学公司的金额达到59亿美元,一年增长高达3倍,超过非计算生物学公司投资的两倍。在2019年以来首次完成种子轮/A轮融资的707家生物制药和研发工具公司中,计算生物学公司有129家,占比为18%。2021年对计算生物学公司的投资额激增,几乎是2019年和2020年募集资金总和的两倍。

  在我国,各研究机构和企业也正开展相关布局。如近日,由清华大学人工智能产业研究院孵化的AI制药企业华深智药对外宣布,其在AI和生命科学结合领域取得突破:研究人员在蛋白质结构预测方面开发出全新技术。据华深智药官方介绍,该技术仅从单条蛋白序列就能预测出蛋白质3D结构的算法。

  加速药物研发、为精准医疗提供助力

  计算生物学正在改善传统制药行业高投入、高技术、高风险、长周期的特性,加速药物研发过程。有分析机构认为,目前我国计算生物学发展的主要方向仍是AI制药,相关创业公司在2017

(编辑:52站长网)

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